学院的科学研究依托于研究所、工程技术中心、联合研发中心等科研机构，近5年来，先后承担了多项国家自然科学基金、国家“863”课题、省市科技攻关和基金类项目，以及服务于企业的众多横向课题，科研经费呈逐年增长趋势，在2011年突破1000万元。

潮汐能发电、民航发动机寿命预测、数字化医疗检测装备、海产品深加工机器人以及特种管道机器人等领域的科研成果在国内处于领先地位；在数字化设计与制造技术、智能设计与仿真、航天机构可靠性与寿命预测、机构理论及其应用、机电一体化成套装备、游艇和工程船舶的设计与建造、船舶复合材料加工工艺、船舶数字化生产准备与生产过程管理等方面成果显著。